Rețeaua de cercetare a Academiei Române este alcătuită din 70 de institute și centre de cercetare, aflate sub coordonarea secțiilor științifice, și acoperă întreg teritoriul țării, de la București, la Cluj-Napoca, Iași, Timișoara, Craiova, Sibiu, Târgu Mureș. Institutele Academiei Române asigură direcția de cercetare fundamentală din România, dezvoltată în cadrul unor ample proiecte, pe lungi perioade de timp, implicând generații de cercetători.
Unele dintre aceste institute au o tradiție centenară, cum este, spre exemplu, Institutul de Studii Sud-Est Europene, fondat în 1914 de Nicolae Iorga, Gheorghe Murgoci și Vasile Pârvan, inițiativă care a condus la nașterea unui domeniu de cercetare în Europa și a stârnit interesul și pe continentele american și asiatic. Din aceeași perioadă datează importante institute clujene ale Academiei Române, întemeiate imediat după Marea Unire de la 1918, la inițiativa Regelui Ferdinand, ca gest de politică culturală unificatoare: Institutul de Istorie „George Bariţiu“, Institutul de Lingvistică și Istorie Literară „Sextil Pușcariu“, Arhiva de Folclor, Institutul de Arheologie și Istoria Artei.
Un număr semnificativ de institute au fost înființate imediat după 1948, dezvoltând programe de
cercetare în domenii umaniste precum istoria, lingvistica, literatura, artele plastice, și în științele
tari: chimie, biologie, biochimie, matematică, astronomie. Un caz aparte îl constituie Institutul de
Biologie și Patologie Celulară, fondat în 1979 la București, în plin regim comunist, din inițiativa
lui George Emil Palade, laureat al Premiului Nobel în 1974 și profesor în Statele Unite ale
Americii. Acesta a obținut un grant din partea statului american și a încredințat proiectul
cercetătorilor români Maya și Nicolae Simionescu. Astăzi institutul se înscrie în restrânsa familie a
institutelor de recunoscute de Uniunea Europeană ca unități de excelență în cercetare.
Imediat după momentul istoric din decembrie 1989, au fost înființate institute de cercetare care
vizează cu deosebire domeniile prohibite sub regimul dictatorial comunist: economie, sociologie,
filosofie, psihologie, istoria religiilor. În aceeași perioadă au fost puse bazele celor două institute de
tehnologia informației: Institutul de Cercetări pentru Inteligenţă Artificială din Bucureşti și
Institutul de Informatică Teoretică din Iaşi.
Cercetarea științifică în Academia Română este organizată în cadrul unor programe fundamentale, majoritatea decurgând din însăși misiunea instituției și fiind stabilite chiar din momentul înființării ei în 1866. Lor li se adaugă permanent programe și proiecte noi, dezvoltate în institutele și centrele de cercetare ale Academiei, care contribuie la dezvoltarea ştiinţei, literelor şi artelor în ţară.
Centrul de Istorie şi Civilizaţie Europeană, Iaşi
Centrul de Studii Transilvane, Cluj-Napoca
Institutul de Arheologie, Iaşi
Institutul de Arheologie „Vasile Pârvan“, Bucureşti
Institutul de Arheologie şi Istoria Artei, Cluj-Napoca
Institutul de Cercetări Socio-Umane, Sibiu
Institutul de Cercetări Socio-Umane „C.S. Nicolăescu-Plopşor“, Craiova
Institutul de Cercetări Socio-Umane „Gheorghe Şincai“, Târgu Mureş
Institutul de Istorie „A.D. Xenopol“, Iaşi
Institutul de Istorie „George Bariţiu“, Cluj-Napoca
Institutul de Istorie „Nicolae Iorga“, Bucureşti
Institutul de Istoria Religiilor, Bucureşti
Institutul de Studii Sud-Est Europene, Bucureşti
Institutul Naţional „Bucovina“, Rădăuţi
Institutul Naţional pentru Studiul Totalitarismului, Bucureşti
Centrul de Cercetări Demografice „Vladimir Trebici“, Bucureşti
Centrul de Cercetări Financiare şi Monetare „Victor Slăvescu“, Bucureşti
Centrul de Economia Industriei şi Serviciilor, Bucureşti
Centrul de Informare și Documentare Economică, București
Centrul de Modelare Macroeconomică, București
Centrul de Studii de Drept European, București
Centrul European de Studii în Probleme Etnice, Bucureşti
Centrul Român de Economie Comparată şi Consens, Bucureşti
Institutul de Cercetare a Calităţii Vieţii, Bucureşti
Institutul de Cercetări Juridice „Acad. Andrei Rădulescu“, București
Institutul de Economie Agrară, Bucureşti
Institutul de Economie Mondială „Costin Murgescu“, Bucureşti
Institutul de Economie Naţională, Bucureşti
Institutul de Prognoză Economică, Bucureşti
Institutul de Sociologie, București
Institutul Naţional de Cercetări Economice „Costin C. Kiriţescu“ – INCE, Bucureşti