Rețeaua de cercetare a Academiei Române este alcătuită din 70 de institute și centre de cercetare, aflate sub coordonarea secțiilor științifice, și acoperă întreg teritoriul țării, de la București, la Cluj-Napoca, Iași, Timișoara, Craiova, Sibiu, Târgu Mureș. Institutele Academiei Române asigură direcția de cercetare fundamentală din România, dezvoltată în cadrul unor ample proiecte, pe lungi perioade de timp, implicând generații de cercetători.
Unele dintre aceste institute au o tradiție centenară, cum este, spre exemplu, Institutul de Studii Sud-Est Europene, fondat în 1914 de Nicolae Iorga, Gheorghe Murgoci și Vasile Pârvan, inițiativă care a condus la nașterea unui domeniu de cercetare în Europa și a stârnit interesul și pe continentele american și asiatic. Din aceeași perioadă datează importante institute clujene ale Academiei Române, întemeiate imediat după Marea Unire de la 1918, la inițiativa Regelui Ferdinand, ca gest de politică culturală unificatoare: Institutul de Istorie „George Bariţiu“, Institutul de Lingvistică și Istorie Literară „Sextil Pușcariu“, Arhiva de Folclor, Institutul de Arheologie și Istoria Artei.
Institutul de Filologie Română „Alexandru Philippide“, Iași
Institutul de Istorie și Teorie Literară „George Călinescu“, București
Institutul de Lingvistică „Iorgu Iordan - Alexandru Rosetti“, București
Institutul de Lingvistică şi Istorie Literară „Sextil Puşcariu“, Cluj-Napoca
Institutul de Cercetări Socio-Umane din Timişoara - „Titu Maiorescu”
Centrul de Studii Transilvane, Cluj-Napoca
Institutul de Arheologie, Iaşi
Institutul de Arheologie „Vasile Pârvan“, Bucureşti
Institutul de Arheologie şi Istoria Artei, Cluj-Napoca
Institutul de Cercetări Socio-Umane, Sibiu
Institutul de Cercetări Socio-Umane „C.S. Nicolăescu-Plopşor“, Craiova
Institutul de Cercetări Socio-Umane „Gheorghe Şincai“, Târgu Mureş
Institutul de Istorie „A.D. Xenopol“, Iaşi
Institutul de Istorie „George Bariţiu“, Cluj-Napoca
Institutul de Istorie „Nicolae Iorga“, Bucureşti
Institutul de Istoria Religiilor, Bucureşti
Institutul de Studii Sud-Est Europene, Bucureşti
Institutul Naţional „Bucovina“, Rădăuţi
Institutul Naţional pentru Studiul Totalitarismului, Bucureşti
Institutul Naţional de Cercetări Economice „Costin C. Kiriţescu“ – INCE, Bucureşti
Institutul de Economie Naţională, Bucureşti
Institutul de Prognoză Economică, Bucureşti
Institutul de Economie Mondială „Costin Murgescu“, Bucureşti
Institutul de Economie Agrară, Bucureşti
Institutul de Cercetare a Calităţii Vieţii, Bucureşti
Centrul de Economia Industriei şi Serviciilor, Bucureşti
Centrul de Cercetări Financiare şi Monetare „Victor Slăvescu“, Bucureşti
Centrul de Economie Montană CE-MONT, Vatra Dornei
Centrul de Studii şi Cercetări de Biodiversitate Agrosilvică „Acad. David Davidescu“, Bucureşti
Centrul de Informare şi Documentare Economică, București
Institutul de Cercetări Juridice „Acad. Andrei Rădulescu“, București
Institutul de Sociologie, București